Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Reep3Q99KK1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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