Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctu1Q99J10 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms