Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thoc3Q8VE80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thoc3Q8VE80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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