Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fyco1Q8VDC1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fyco1Q8VDC1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms