Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc8Q8VD72 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc8Q8VD72 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc8Q8VD72 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc8Q8VD72 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc8Q8VD72 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc8Q8VD72 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc8Q8VD72 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms