Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FgbQ8K0E8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FgbQ8K0E8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms