Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trip10Q8CJ53 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms