Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpm6Q8CIR4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms