Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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