Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Bcas3Q8CCN5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Bcas3Q8CCN5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bcas3Q8CCN5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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