Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhsl1Q8CAF4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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