Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfrp1Q8C4U3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms