Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trerf1Q8BXJ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms