Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms