Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cct8l1Q80YT3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cct8l1Q80YT3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms