Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms