Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2eQ80UW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2eQ80UW8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms