Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttll4Q80UG8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttll4Q80UG8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Ttll4Q80UG8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttll4Q80UG8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ttll4Q80UG8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttll4Q80UG8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttll4Q80UG8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms