Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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