Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raver2Q7TPD6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raver2Q7TPD6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms