Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vma21Q78T54 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vma21Q78T54 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Vma21Q78T54 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Vma21Q78T54 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vma21Q78T54 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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