Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms