Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms