Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms