Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp34Q6ZQ93 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Usp34Q6ZQ93 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp34Q6ZQ93 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms