Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timd4Q6U7R4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms