Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trak1Q6PD31 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms