Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms