Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp49Q6P9L4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp49Q6P9L4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms