Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smchd1Q6P5D8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smchd1Q6P5D8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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