Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms