Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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