Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt40Q6IFX3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt40Q6IFX3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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