Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms