Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms