Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CltcQ68FD5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CltcQ68FD5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms