Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim24Q64127 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim24Q64127 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim24Q64127 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim24Q64127 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim24Q64127 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms