Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pan3Q640Q5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms