Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PatjQ63ZW7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PatjQ63ZW7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms