Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp4Q62445 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp4Q62445 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms