Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hoxa13Q62424 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa13Q62424 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa13Q62424 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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