Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HrQ61645 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HrQ61645 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HrQ61645 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HrQ61645 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HrQ61645 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HrQ61645 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HrQ61645 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HrQ61645 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HrQ61645 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HrQ61645 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms