Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxd1Q61345 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Foxd1Q61345 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms