Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfap2bQ61313 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2bQ61313 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms