Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nell2Q61220 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms