Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NinQ61043 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NinQ61043 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms