Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift20Q61025 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms