Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Neurod1Q60867 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Neurod1Q60867 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms