Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc6a4Q60857 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc6a4Q60857 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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