Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms